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WB实验总结|显影条带异常分析&解决思路

7/9/2024 4:10:00 PM

 

 

 

问题一:

条带呈现波浪状,形似“八爪鱼”,丑丑不好看?

 

图1:改善前 

 

图2:改善后

 

问题分析:

胶没凝固好或者制胶体系有问题?电流电压不稳?

问题解决:
回顾实验,制胶采用制胶试剂盒严格按照说明书比例进行配制,故而延长了凝胶时间,重新实验后仍未改善,由此怀疑电流电压不稳。
实验室电泳液的配制为:TRIS(3.02g)+ 甘氨酸(14.42g)+SDS(1g)+ 纯水(1L),怀疑是称量不准导致,换用成品的电泳缓冲液粉后条带立马变直(注:成品电泳缓冲液粉虽比较贵,但重复使用两三次是没有问题的)。

 

问题二:

目的带背景深

图1:20ug蛋白上样量与30ug蛋白上样量对比图

 
图2:20ug蛋白量,洗膜5次,且加大PBST用量后
 
图3:30ug蛋白量,洗膜5次,且加大PBST用量后
 
问题分析:

蛋白上样量大?洗膜不充分?封闭液(脱脂牛奶)浓度低,时间短?

问题解决:
对比图可知,蛋白上样量大确实会产生较深的背景,最终以:
  • 20ug的蛋白上样量
  • .7.5%的脱脂牛奶室温封闭1h(改善前条件为:5%脱脂牛奶室温封闭1h;注:必要时也可延长封闭时间)
  • PBST洗膜5次,每次5min,并加大了每次洗涤PBST的用量,7-8ml(改善前条件:洗膜3次,每次5min,PBST用量少,4ml左右)
 

最后成功实现显影条带降背景。

 

问题三:

隐约可见的目的带甚至无目的带?

图1:换用新配制二抗,无目的带出现
 
图2:重新配制二抗,仍无目的带(未换离心管)
 
问题分析:

蛋白表达低?抗体浓度太低或孵育时间太短?转膜失败?或许是二抗出现问题!

问题解决:
同一个蛋白,同样的抗体孵育条件,唯一不同的是换用了新配制的二抗,二抗的稀释比例及孵育条件均未改变,重新配制二抗后仍无条带出现。
忽然注意到一个小细节,就是因为两次配制二抗间隔时间不久,所以未换用新的离心管,有可能是其引起。
换用新的离心管重新配制后,目的带出现,由此可见任何可能被忽略的小细节均有可能导致实验的失败哦!
 

问题四:

显影出现黑斑,或者出现细沙样均匀的黑颗粒样物质,呈现磨砂玻璃样

 
问题分析:
转膜时转膜液中有未溶解的颗粒状物附着在了膜上?封闭时脱脂牛奶未溶解完全?二抗有问题?
问题解决:
转膜液配制时采用磁力搅拌器使其充分溶解,多次实验发现不均匀的黑斑多是脱脂牛奶未溶解完全导致。
所以脱脂牛奶的配制要十分小心,每次配完脱脂牛奶后先在涡旋振荡器上振荡混匀几分钟,然后放置与摇床上使其充分溶解。
小tip:脱脂牛奶的配制不宜太早或太迟,太早配制可能会引起变质,太迟配制影响其溶解,可在电泳开始后进行配制,配制完成后可短暂放于4℃冰箱保存。
而均匀的细小黑斑通常由二抗使用次数过多,长期未更换引起,更换二抗即可恢复正常。

 

 

本文作者是"夏沫梦鸢"同学,这篇文章是他精心汇总的关于Western blot最后一部显影操作中出现的4种条带异常的现象及解决方案。在获得他的授权后,实验老司机将本文发表于公众号。

 

文稿:夏沫梦鸢

校对:樊振华

素材:Canva

参考资料:

  • https://iubmb.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bmb.21516
  • https://histogene.co/western-3/
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